牟尼后寺座落在松潘县牟尼乡三联村，位于县城与西、东南及南面与安宏乡，红土乡连接、西南面与红扎、燕云乡毗邻，海拔3045米。由于该寺矗立在风景秀丽的扎嘎沟内，寺院依山傍水，背面是茂密的原始森林，正面是隆岗沟，左面是气势宏伟的扎嘎大瀑布。夏日，风和日丽，艳阳高照，在牟泥沟后寺院内便能听到扎嘎大瀑布如雷的吼声，自旅游开放以来这里每年游人如织。

        该寺院属格鲁派，始建于公元1663年，由冻戈容登见措、洛让若巴等先后所建，至今已有335年的历史。该寺院由于历史原因。曾先后搬迁过三次，现在的寺院是最后一次所迁的位置。

        民改前寺院有和尚110人，活佛1人，喇嘛3人，堪布1人，格西2人，寺院占地面积23333平方米，有庙房45栋，(和尚私房36栋，集体房6栋)。有各种经书815本，甘珠尔经3套，银菩萨3尊，铜菩萨2750年泥菩萨1043尊，陈香木菩萨11尊，挂布菩萨92张，五层珊瑚树一个，灵塔2个。

        由于历史原因，1958年以后，至“文革”期间，寺院被毁，僧人都回家参加劳动，十一届三中全会以来，宗教政策得到落实，于1980年1月，经州县人民政府批准开放，寺院现有和尚31人，活佛1人。

        寺院现有庙房23栋，集体住房6栋，各种经书119本，甘珠尔经一套，铜菩萨300尊、泥菩萨32尊，陈香木菩萨2尊，唐卡32张。该寺每年宗教活动农历一月十五和七月十五日，共2次大型活动。参加人数多则2000余人，该寺在甘肃、西藏、黑水、松潘影响较广。